Créé en 1981, le Cemagref est un Etablissement public à caractère scientifique et technologique placé sous la double tutelle des ministères en charge de la recherche et de l'agriculture. Il a pour mission de développer une recherche environnementale intégrative tournée vers l'action publique et privée. 

Premier opérateur de recherche français dans le domaine de l'eau, son champ d'investigation se situe à l'échelle du territoire, aux interfaces des enjeux "agriculture–environnement" et des enjeux "rural-urbain". Il apporte également une contribution significative à l'effort de formation de spécialistes en sciences et technologies de l'environnement, via des activités d'enseignement et de formation par la recherche.

Le plan stratégique "Cemagref 2020" a défini 3 grandes priorités stratégiques :

- La qualité environnementale : coupler méthodes et technologies pour comprendre et agir

- La gestion durable des eaux et des territoires : généraliser les approches multisectorielles pour mieux intégrer "eaux et territoires"

- La gestion des risques naturels : élargir l'approche des risques par l'étude de la viabilité des systèmes environnementaux